Институт фундаментальной системной инженерии - подразделение по подготовке специалистов нового типа, которые могут не только разрабатывать передовые устройства и технологии, но и внедрять их на предприятиях.
 
Институт готовит для региона кадры, которые могут реализовывать инновационные научные и инженерные идеи. Студенты изучают на фундаментальном уровне физику, химию, материаловедение, математику и получат специализацию под запросы конкретных предприятий. Институт является мостом между академической наукой и реальными инженерными задачами.

«Институт фундаментальной системной инженерии — новая форма инженерного образования, которая направлена на усиление технологической части классического естественнонаучного образования, — считает директор института фундаментальной системной инженерии Сергей Ваулин. — Институт позволяет подготовить специалистов в области физики, химии и математики для создания технических объектов полного жизненного цикла. Такая программа на сегодняшний день реализуется только в МГУ им. М. В. Ломоносова и ЧелГУ. Предприятиям необходимы не только инженеры-энергетики или инженеры-механики, но и специалисты междисциплинарного профиля, разбирающиеся в IT-технологиях, умеющие работать с документацией, знающие специфику работы с ЧПУ, разбирающиеся в экологии окружающей среды и так далее». 

Институт объединяет центр инженерных разработок и студенческое конструкторское бюро.

Благодаря совмещению научно-исследовательской и опытно-конструкторской работы институт создаёт синергетический эффект. Будущие специалисты будут решать задачи по импортозамещению и развитию исследований на стыке фундаментальных наук и современных инженерных дисциплин.

Институт ведёт подготовку по двум направлениям магистратуры: 

  1. Фундаментальная информатика и информационные технологии, профиль «Робототехника».
  2. Физика, профиль «Теоретическая и математическая физика».